Spatial analyzes of HLA data in Rio Grande do Sul, south Brazil: genetic structure and possible correlation with autoimmune diseases

Boquett, Juliano André; Zagonel-Oliveira, Marcelo; Jobim, Luis Fernando; Jobim, Mariana; Gonzaga, Luiz; Veronez, Maurício Roberto; Fagundes, Nelson Jurandi Rosa; Schüler-Faccini, Lavínia

doi:10.1186/s12942-018-0154-8

International Journal of Health Geographics

Table 1 Spearman correlation (ρ) between alleles and diseases

From: Spatial analyzes of HLA data in Rio Grande do Sul, south Brazil: genetic structure and possible correlation with autoimmune diseases

HLA-A	RA	MS	CD	HLA-B	RA	MS	CD	HLA-DRB1	RA	MS	CD
A*01	0.124	0.072	− 0.198	B*07	0.146	0.135	− 0.079	DRB1*01	0.016	− 0.088	0.187
A*02	− 0.018	− 0.008	− 0.125	B*08	0.327*	0.218	− 0.005	DRB1*03	0.210	0.102	0.036
A*03	0.008	0.021	− 0.072	B*13	0.046	0.037	− 0.143	DRB1*04	0.054	0.162	− 0.249
A*11	− 0.108	− 0.118	− 0.089	B*14	− 0.077	− 0.049	0.100	DRB1*07	− 0.182	− 0.117	0.143
A*23	− 0.166	− 0.255	− 0.017	B*15	0.077	0.083	− 0.020	DRB1*08	− 0.220	− 0.168	0.066
A*24	− 0.059	− 0.084	0.036	B*18	0.169	0.056	0.027	DRB1*09	− 0.089	− 0.091	− 0.004
A*25	0.150	0.075	− 0.113	B*27	0.094	0.067	− 0.199	DRB1*10	− 0.059	− 0.008	0.101
A*26	0.045	0.002	0.149	B*35	0.029	− 0.013	0.125	DRB1*11	0.046	0.032	0.112
A*29	− 0.207	− 0.203	0.197	B*37	− 0.178	− 0.157	0.028	DRB1*12	− 0.121	− 0.150	− 0.180
A*30	− 0.131	− 0.055	0.172	B*38	− 0.038	− 0.111	0.195	DRB1*13	− 0.115	− 0.060	− 0.094
A*31	− 0.040	− 0.085	− 0.003	B*39	− 0.017	− 0.060	0.158	DRB1*14	− 0.066	− 0.077	− 0.005
A*32	0.093	0.133	− 0.119	B*40	− 0.034	0.001	− 0.248	DRB1*15	0.047	0.030	− 0.015
A*33	− 0.011	0.034	0.088	B*41	− 0.156	− 0.136	− 0.096	DRB1*16	− 0.230	− 0.265	− 0.084
A*34	− 0.313	− 0.229	0.065	B*42	− 0.111	− 0.047	0.167
A*36	− 0.149	− 0.123	0.149	B*44	− 0.179	− 0.089	0.022
A*43	0.020	0.073	− 0.054	B*45	− 0.211	− 0.178	0.024
A*66	− 0.110	− 0.090	0.014	B*46	0.073	0.052	0.038
A*68	0.056	0.043	0.149	B*47	− 0.155	− 0.168	0.028
A*69	− 0.126	− 0.120	− 0.016	B*48	− 0.218	− 0.120	0.049
A*74	− 0.197	− 0.185	0.089	B*49	− 0.123	− 0.148	0.004
A*80	− 0.143	− 0.072	− 0.016	B*50	− 0.371	− 0.306	0.088
				B*51	− 0.007	0.006	0.031
				B*52	0.019	0.026	0.150
				B*53	− 0.200	− 0.148	0.078
				B*54	0.091	0.101	0.078
				B*55	− 0.120	− 0.188	− 0.067
				B*56	− 0.015	0.052	0.066
				B*57	0.010	0.027	− 0.077
				B*58	− 0.191	− 0.182	0.076
				B*59	− 0.099	− 0.083	− 0.001
				B*67	− 0.010	0.004	− 0.042
				B*73	− 0.106	− 0.069	0.005
				B*78	− 0.050	0.002	− 0.006
				B*81	− 0.289	− 0.242	0.012
				B*82	− 0.098	− 0.064	0.106

RA Rheumatoid arthritis, MS multiple sclerosis, CD Crohn’s disease
Italic: Positive correlation; P ≤ 0.05
*Remained significant even after correction by FDR

Back to article page

ISSN: 1476-072X

Contact us

Submission enquiries: journalsubmissions@springernature.com